Seminarios Institucionales

Seminario 23/11: Variabilidad genómica del virus Epstein Barr: su relación con la geografía y la genética poblacional


Título: Variabilidad genómica del virus Epstein Barr: su relación con la geografía y la genética
poblacional

Disertante: Bioq. Catalina Blazquez (IMIPP-CONICET, Hospital de Niños R. Gutiérrez)

Resumen:

En los últimos años, con el advenimiento de las tecnologías de secuenciación masiva, se
secuenciaron más de 1000 genomas completos de EBV aislados en distintas geografías; sin
embargo, una de las principales limitaciones en los estudios de estructura poblacional realizados a
partir de los genomas completos de EBV, es la ausencia de secuencias procedentes de América del
Sur. Con el fin de solucionar esta limitación, en este trabajo, hemos secuenciado y analizado 40
genomas completos de EBV aislados en pacientes pediátricos de Argentina. A su vez, se
descargaron del NCBI los datos crudos, disponibles públicamente, de otros 230 aislamientos de
EBV de otras regiones del mundo. Los mencionados datos fueron analizados mediante un pipeline
bioinformático personalizado junto con los datos propios generados en este proyecto. Mediante la
reconstrucción de las relaciones filogenéticas de los genomas y el análisis de variabilidad del
conjunto de datos se ha estudiado con mayor profundidad la estructura geográfica de las
secuencias y se ha determinado la contribución real de cada región del genoma de EBV a la
segregación geográfica de los genomas completos. Se identificaron epitopes sobre aquellas
proteínas que presentaron marcada estructura geográfica, con el fin de evidenciar un posible
efecto de adaptación viral. Finalmente, establecimos por primera vez la tasa de evolución del
genoma completo de EBV; un nuevo dato que cuestiona la teoría de codivergencia entre el virus y
su hospedador. Finalmente, evaluamos la tasa de evolución de los principales genes virales y lo
analizamos en el contexto de la funcionalidad biológica de los mismos.