Título: Estudio de la variabilidad genética de las proteínas no estructurales de Rotavirus grupo A
Disertante: Lic. Gomez Quintero, Emiliano Lautaro
Becario Doctoral CONICET
Director: Dr. Miño, Orlando Samuel
Codirector: Dra. Salvatierra, Karina Alejandra
Laboratorio de Biología Molecular Aplicada. Módulo de Bioquímica y Farmacia, FCEQyN – UNaM
Resumen:
Los Rotavirus grupo A (RVA), son los principales agentes etiológicos responsables de gastroenteritis agudas en niños menores de cinco años alrededor del mundo. También afectan a mamíferos y aves juveniles. El virión completo de RVA es una partícula icosaédrica, compuesta de tres capas concéntricas de proteínas, que envuelven 11 segmentos de ARN de doble cadena (ARNds). Cada segmento codifica una proteína, seis estructurales (VP1-VP4, VP6 y VP7) y cinco o seis proteínas no estructurales (NSP1-NSP5/6). En 2008 se implementó un sistema de clasificación basado en el genoma completo de RVA. Este sistema asigna un genotipo específico para cada uno de los once segmentos de una cepa particular de acuerdo con valores de corte establecidos. Utilizando este enfoque, el genoma completo de una cepa RVA se describe como: Gx-P[x]-Ix-Rx-Cx-Mx-Ax-Nx-Tx-Ex-Hx para los genes VP7-VP4-VP6-VP1-VP2-VP3-NSP1-NSP2-NSP3-NSP4-NSP5/6, respectivamente. Desde la implementación de este sistema, el número de genotipos ha aumentado sustancialmente: para VP7 (G19-G36), VP4 (P[27]-P[51]), VP6 (I11-I26), VP1 (R4-22), VP2 (C5-C20), VP3 (M6-M20), NSP1 (A14-A31), NSP2 (N5-N22), NSP3 (T7-T22), NSP4 (E11-E27) y NSP5/6 (H6-H22). Debido a esto, el objetivo de este trabajo fue analizar la variabilidad genética y llevar a cabo análisis filogenéticos de cada una de los genes no estructurales (NSP1-NSP5) y corroborar si los valores de cortes siguen vigentes. Se construyeron matrices de alineamientos múltiples para analizar las distancias genéticas para cada gen y así evaluar si los genotipos estaban correctamente asignados considerando los valores de corte. Encontramos que, para NSP1, NSP2, NSP3, NSP4 y NSP5, el 23% (7/31), 23% (5/22), 37% (8/22), 26% (7/27) y 23% (5/22) respectivamente, estaban por encima del valor de corte. Varios de estos conflictos, podrían ser resueltos considerando los análisis filogenéticos. Todas las proteínas no estructurales, tenían genotipos en conflicto donde el valor de corte actual no es óptimo. En algunos casos, los análisis filogenéticos podría ser una herramienta útil para respaldar la clasificación. Este trabajo destaca nuestro conocimiento actual sobre la variabilidad de nucleotídica de las proteínas no estructurales de RVA, así como preguntas fascinantes a las que enfrentarse. Además, destaca la necesidad de que se mantenga el trabajo continuo del RCWG.
